Contrairement au format habituel, les éliminatoires pour la CAN 2013 en Afrique du sud se dérouleront selon un système de matches aller-retour à élimination directe. Les équipes qui participent à la CAN 2012 n'auront que deux matches à disputer pour se qualifier à la CAN 2013. Pour la CAN 2015 au Maroc, les éliminatoires retrouveront leur mode de qualification classique avec des poules
PREMIER TOUR
match ALLER 29 février 2012
Ethiopie - Bénin
Rwanda - Nigeria
Congo - Ouganda
Burundi - Zimbabwe
Algérie - Gambie
Kenya - Togo
Sao Tome ou Lesotho - Sierra Leone
Guinée Bissau - Cameroun
Tchad - Malawi
Seychelles - RD Congo
Tanzanie - Mozambique
République Centrafrique - Egypte
Madagascar - Cap Vert
Liberia - Namibie
PREMIER TOUR
match ALLER 29 février 2012
Ethiopie - Bénin
Rwanda - Nigeria
Congo - Ouganda
Burundi - Zimbabwe
Algérie - Gambie
Kenya - Togo
Sao Tome ou Lesotho - Sierra Leone
Guinée Bissau - Cameroun
Tchad - Malawi
Seychelles - RD Congo
Tanzanie - Mozambique
République Centrafrique - Egypte
Madagascar - Cap Vert
Liberia - Namibie