Le tirage au sort aura lieu le 8 avril au Caire et il aura 13 groupes de 4 équipes seul les premiers des poules et les deux meilleurs deuxièmes seront qualifiés à la can 2017 et pour la première fois le pays organisateur va participé aux éliminatoires mais ses points ne compteront pas c'est pour ça qu'il aura un seul qualifié dans son groupe.
C'est le classement caf des résultats des trois dernières can (2015, 2013, 2012) qui a été pris en compte:
Pot 1: Cote ivoire, Ghana, Nigeria, Zambie, Burkina Faso, Mali, Tunisie, Algerie
, Cap Vert, Rd Congo, Afrique du sud, Guinée, Cameroun
Pot 2: Angola, Gabon, Sénégal, Egypte, Togo, Ethiopie, Niger, Guinée Equatoriale, Soudan, Libye, Congo, Botswana, Malawi
Pot 3: Ouganda, Mozambique, Bénin, Sierra Leone, Centrafrique, Zimbabwe, Kenya, Liberia, Gambie, Rwanda, Tanzanie, Namibie, Burundi
Pot 4: Lesotho, Guinée Bissau, Madagascar, Tchad, Sao Tomé et Principe, Seychelles, iles Comores, Swaziland, ile Maurice, Erythrée, Mauritanie, Soudan du sud, Djibouti
C'est le classement caf des résultats des trois dernières can (2015, 2013, 2012) qui a été pris en compte:
Pot 1: Cote ivoire, Ghana, Nigeria, Zambie, Burkina Faso, Mali, Tunisie, Algerie
Pot 2: Angola, Gabon, Sénégal, Egypte, Togo, Ethiopie, Niger, Guinée Equatoriale, Soudan, Libye, Congo, Botswana, Malawi
Pot 3: Ouganda, Mozambique, Bénin, Sierra Leone, Centrafrique, Zimbabwe, Kenya, Liberia, Gambie, Rwanda, Tanzanie, Namibie, Burundi
Pot 4: Lesotho, Guinée Bissau, Madagascar, Tchad, Sao Tomé et Principe, Seychelles, iles Comores, Swaziland, ile Maurice, Erythrée, Mauritanie, Soudan du sud, Djibouti